A természetben mikroorganizmusok képződnek vegyes populációk más típusú mikroorganizmusokkal. Ezen elegyek tenyészeteit tehát ún vegyes növények. A mikroorganizmusok ismeretét azonban a laboratóriumban tenyésztett izolált törzsek tanulmányozásával érik el tiszta kultúrák (vagy axonikus). Néha a molekuláris vizsgálat mikroorganizmusok jellemzéséhez vezet, még vegyes populációkban is. A baktériumok azonosítása és teljes jellemzése azonban csak a baktérium izolálása és tiszta tenyészetek megszerzése után lehetséges. Ezért egy baktérium vizsgálata során az első probléma az izolálása a többi mikroorganizmustól (kóros mintában, vízben, talajban, ételben stb.). Az izolálás elérése után meg lehet szerezni az érdekes baktériumokat tiszta termesztés.
1. Szigetelés
Egy bizonyos mikroorganizmus elválasztása az őt kísérő többi mikroorganizmustól. A leggyakoribb módszer az csíkvetés Petri-csészébe helyezett megfelelő szilárd táptalajon.
Ehhez kis mennyiségű mintát veszünk egy platina hurokkal, és elosztjuk a táptalaj felületén. A baktériumsejteket elválasztják és immobilizálják a táptalajon. Megfelelő körülmények között végzett inkubálás után mindegyik életképes sejt származik a Külváros az egymást követő sejtosztódások látható eredménye. Minden baktériumtelepnek bizonyos tulajdonságai vannak alakja, határa, magassága, mérete, konzisztenciája stb. Tekintetében. Az eredeti mintában jelen lévő baktériumtípusok különböző teleptípusokként láthatók. Megfelelően elkülönített telepekből tiszta kultúrát lehet kapni az eredeti mintában jelen lévő baktériumtípusok mindegyikéből...
Az izolálás és a táptalajon történő elválasztás sikere attól a felülettől függ, amelyen a mintát elosztották. Nagyon fontos, hogy minél több striát készítsünk. Az első csíkokban összefolyó telepek vagy folyamatos mikroorganizmus-tömeg jelenik meg. Az egymástól elválasztott telepeknek az utolsó csíkokban kell megjelenniük. Az izoláláshoz alacsony kiindulási oltás szükséges. A hurok populációjának egymás utáni csökkenésének (a táptalajon történő kisülés miatt) a táptalajon való áthaladáskor biztosítani kell, hogy végül egyes sejtek kellően elkülönüljenek (egymástól elkülönítve) maradjanak a felszínen
A telepek differenciálásának kritériumai
A telepek megjelenése, színük, méretük stb. Lehetővé teszik a különböző baktériumok megkülönböztetését, bár általános tulajdonságait nagymértékben befolyásolják a tenyésztési körülmények, ezért az alábbiakban egy nagyon általános leírást adunk. A telepek lehetnek átlátszatlanok, áttetszők vagy átlátszók. Néhány ultraibolya fénnyel megvilágítva fluoreszkáló pigmenteket termel. Mások poros felületűek, mások simaak vagy érdesek, vagy koncentrikus gyűrűvel rendelkeznek. Néha a szag is jellemző
a bakteriális kolóniák profilképe a TSA-n
Gyarmata Serratia: nyálkás megjelenés, a központi részen pigmentálódni kezd
2. Tiszta kultúrák megszerzése
A cél egyetlen mikrobatípus tenyésztése táptalajban, például tápanyag agar ferde csövében. Ehhez kis mennyiségű baktériumtömeget nyernek egy szétválasztott telepből, elszigetelten. Ezzel egy új táptalajt oltunk be, amely csíkokat hoz szorosan egymáshoz. Megfelelő körülmények között történő inkubálás tiszta kultúrát eredményez. A folyamat minden teleptípusra megismételhető. Az eredeti mintában együtt létező mikroorganizmusok tiszta, különálló tenyészeteinek gyűjteményét kapjuk
.A tiszta tenyészet megszerzése előtt célszerű második izolálást végezni. Ha a második lemez összes telepe azonos, akkor az egyiket felhasználhatjuk a tiszta tenyészet létrehozására. Ha a tenyészet tiszta, akkor Gram-folt segítségével célszerű ellenőrizni annak tisztaságát. A tiszta mikroorganizmus-tenyészeteket a laboratóriumban fenntartja újraküldés (egyik táptalajról a másikra kerül) egymás után. Az egyik példány liofilizálható konzerválás céljából