szeminárium

Posztgraduális szeminárium

A TUDOMÁNY Mestermestere a tengeri erőforrások kezelésében

HALÁSZATI ÉS TENGERBIOLÓGIAI TANSZÉK

2020. november 6

Virtuális bemutató a Microsoft Teams-ben, 10:00

A kék bálna étrend változékonysága molekuláris eszkatológiával

Vladimir Delgado Rodriguez

A cetfélék főként a nagyon produktív régiókban terjednek el, ahol nagy mennyiségű zsákmányhalmazok, például mezozooplankton, kisebb nyílt vízi élőhelyek, mitofidok és lábasfejűek bővelkednek.

A kék bálnát megfeszített fajnak tekintik; a Kaliforniai-öbölben a székletben lévő kemény maradványok elemzésével kiderült, hogy főként az euphausiid (Nyctiphanes simplex) táplálkozik, amelyet a székletben végzett DNS-amplifikáció, a Molecular Eschatology nevű technika is megerősített.

Ezzel a technikával azonban azt is kimutatták, hogy a kék bálnák beveszik a mikofidokat. Tekintettel a kék bálnák által a régióban 2015 óta megfigyelhető tartós testállapot-csökkenésre, várhatóan 2015-től észlelni fogja e faj étrendjének változását a Kaliforniai-öbölben, a Csendes-óceán északkeleti részén található egyik fő táplálkozási területén.

A kék bálna ürülékből (2008-2020) 52 mintát választottak ki, átlagosan évente 4 mintát nőstényeknek és hímeknek, amelyekből 1,5 ml részmintát nyertek a DNS-extrahálás elvégzésére egy speciális széklet segítségével a széklet elemzésére. (QIAamp DNS Stool ).

A masszív szekvenálási technika alkalmazásával az univerzális markert használják, amely amplifikálja a 18-as évekbeli rRNS gén régiót, az 52 mintát szekvenálják, valamint kontrollmintákat (tengervíz és PCR vak) az illumina platformon. Ez a technika lehetővé teszi az összes lehetséges zsákmány jelenlétének és relatív bőségének kimutatását és azonosítását családi szinten a kék bálna ürülékében.

A kapott szekvenciák (családok) számától függően bioinformatikai elemzéssel és statisztikai vizsgálatokkal vizsgálják, hogy a Kalifornia-öbölben e faj étrendjében az elmúlt években a test állapotának csökkenésével összefüggésben történt-e mennyiségi változás.

Kulcsszavak: Széklet, zsákmány, Next Generation Sequencing, kék bálna