módszerrel

Egy új módszer, amely kombinált proteomikai és genomikai megközelítést alkalmazott a szérumfehérjék oldatban történő profilozásához, nagy pontosságot mutatott a hasnyálmirigyrákos betegekből származó minták és az egészséges kontrollok megkülönböztetésében.

A vérszérumban található fehérjekompozíció tükrözi az egyén aktuális egészségi állapotát, és megfelelő eszközökkel fel lehet használni a betegség korai jeleinek, például a kialakuló rák felderítésére. Mivel az Egészségügyi Világszervezet (WHO) előrejelzése szerint az összes rák egyharmada meggyógyulhat, ha a daganat I/II stádiumában diagnosztizálják, a rák korai diagnosztizálása nagymértékben növeli a betegek jobb eredményének esélyét.

Ebben az értelemben a Lundi Egyetem (Svédország) kutatói és munkatársai az Immunovia AB (Lund, Svédország) orvosbiológiai társaságtól kidolgoztak egy módszert, amely az antitestek specifitását a következő generációs szekvenálás (NGS) érzékenységével ötvözte.

Ez a ProMIS technika (rövidítve a fehérje kimutatására a Multiplex Immunoassay in Solution segítségével) egy optimalizált platform a szérum fehérje profilozásához oldat-alapú mikroszféra tömbben. A vizsgálatban olyan antitestfragmenseket (scFv) használnak, amelyeket specifikusan konjugáltak a DNS oligonukleotid vonalkódokhoz, 1: 1 módon, Sortase A-közvetített kapcsolási stratégiát alkalmazva. gyöngyöket és kötött antitesteket detektáltunk NGS alkalmazásával, lehetővé téve a többszörös és érzékeny leolvasást.

Az oldatban lévő fehérjékkel végzett munkával az új technika elkerülte a benne rejlő technikai problémákat, amelyek a hagyományos biomarker-kutatás során felmerültek biomatrikumok, például lapos vagy gyöngyalapú tömbök alkalmazásával.

„Az évek során fejlett diagnosztikai módszereket dolgoztunk ki a szérumfehérjék multiplex elemzésére, egyetlen csepp vér felhasználásával, a komplex betegségek, különösen a rák korai diagnosztizálása céljából. Rengeteg információ van a vérben, és a proteomika és a genomika kombinációja megnyílik, hogy gyorsan társítsa a tumor korai fejlődését a fehérje aláírásokkal. Ez pedig kedvezőbb kimenetelű és teljes túléléssel rendelkező betegek javát szolgálja. Nagyon izgatottak vagyunk az új, következő generációs biomarker-felfedező eszköz miatt. ”- mondta Dr. Carl Borrebaeck vezető szerző, a Lundi Egyetem immunotechnológiai professzora.

A ProMIS technikát a Nature Communication Biology folyóirat 2020. július 3-i online kiadása írta le.